シナリオBの『シナリオ設定』で
メールアドレス・LINE友だち統合設定＞LINE友だち追加後フォーム経由のメール情報の統合
を「利用しない」と設定する必要があります。
メールアドレス・LINE友だち統合設定＞
「LINE友だち追加後フォーム経由のメール情報の統合」：「利用しない」
「LINE友だち追加後フォーム経由のメール情報の統合」：「利用しない」
と設定した場合、
シナリオAにLINE登録
↓
シナリオAのLINEステップ配信でオプトインLPを送信
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シナリオAのLINEステップ配信でオプトインLPを送信
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LPの登録フォーム（シナリオBに連携）からメールアドレス登録
上記の場合、シナリオBでLINE情報とメールアドレスが統合して登録されます。
※「LINE友だち追加後フォーム経由のメール情報の統合」＞「利用する」と設定すると、シナリオBにLINE情報が引き継がれない形となります。