独自ドメイン管理からサブドメインを登録後でも、受講生のログインには支障は発生いたしません。
会員サイトURL、受講生ログイン情報の仕様について
UTAGEの仕様では、デフォルトのUTAGEドメイン、独自ドメイン(サブドメイン)に関わらず、
内部の受講生データは共通化されています。
例）
独自ドメイン管理からサブドメイン「sub.aaa.com」「sub.bbb.com」を追加して
UTAGEドメインを含め3種類の会員サイトログインURLが存在する場合
そのため、どの会員サイトログインURLからでも同一のログイン情報
（メールアドレス、パスワード）にて受講生ログインが可能です。
また、後から独自ドメイン（サブドメイン）を追加登録した場合でも、
既にご利用UTAGEアカウント内で受講生登録が完了していれば、
同一の受講生ログイン情報にて独自ドメイン（サブドメイン）の
会員サイトURLからログインが可能です。
（UTAGEドメインでの受講生ログインも引き続き可能です）